我单位拟推荐李志华、陈敏参与申报2019年度广东省科学技术奖（科技进步奖），特进行公示，公示期：2019年9月11日至2019年9月17日，公示期内如对公示内容有异议，请您向广州医科大学附属第三医院科研管理科反映。
联系人及联系电话：荆冬冬 020-81292198
广州医科大学附属第三医院 科研管理科
项目名称 | 罕见病实验诊断关键技术创新与规模应用 |
主要完成单位 | 单位1广州金域医学检验集团股份有限公司 |
单位2中山大学 | |
单位3 中山大学孙逸仙纪念医院 | |
单位4广州医科大学附属第三医院 | |
单位5广州金域医学检验中心有限公司 | |
单位6上海金域医学检验所有限公司 | |
主要完成人 （职称、工作单位、完成单位） | 1.梁耀铭（教授、硕士、广州金域医学检验集团股份有限公司、广州金域医学检验集团股份有限公司、主要贡献：该项目总负责人，提出项目总体技术设计方案及产业化要求，主导完成了创新点一创新研发了罕见病系列筛查诊断技术，大幅提升检测灵敏度和检测效率；创新点二创建罕见病多组学诊断技术路径，攻克了部分罕见病复杂性、异质性导致无法通过单一检测技术确诊的难题。是2个专利的第一发明人。） |
2.胡朝晖（教授、博士、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验集团股份有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，参与提出项目总体设计方案和要求，负责项目的日常管理、产业化转化及质量控制研究等工作，主导完成了创新点一创新染色体微阵列技术实验方法，解决了绒毛组织DNA提取难、不稳定性的问题，提高了染色体结构变异的检出率，降低了检测成本；创新点三国内首次诊断罕见异常血红蛋白突变[β43(CD2) Glu→Lys]，变异序列被GeneBank收录。是1项专利的发明人，是4篇论文的作者，是2项成果的完成人） | |
3.梁立阳（副主任医师、博士、中山大学孙逸仙纪念医院、中山大学孙逸仙纪念医院、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点三国际上新发现 2 种罕见病基因及基因组变异类型。是2篇代表性论文的主要作者。） | |
4.陈帆（中级、本科、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一创新染色体微阵列技术实验方法，解决了绒毛组织DNA提取难、不稳定性的问题，提高了染色体结构变异的检出率，降低了检测成本。是1篇代表性论文的主要作者。） | |
5.蒋玮莹（教授、博士、中山大学、中山大学、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导创新点二检测血友病B的技术集成创新。研究并建立了一个针对血友病B的全面的基因诊断方案，作为患者和携带者的基因诊断、产前诊断和胚胎植入前诊断（PGD）的有效可行手段应用于中国人群中。是1篇代表性论文的主要作者，是1项成果的主要完成人。） | |
6.吴梦华（无、本科、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一构建染色体核型细胞培养和制片过程新技术途径，解决了原有反应体系中含有毒试剂和培养失败率高的问题，提高了培养成功率和实验操作的安全性。是1篇代表性论文的主要作者。） | |
7.刘晶星（初级、硕士、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一针对NGS数据分析复杂、漏检率高、检出率低、分析模块不衔接和耗时长问题，发明基因变异评估方法并研发NGS数据生物信息分析系统。创新点四构建了基于中国人群数量大、病种全、地域广的罕见病实验诊断数据库及样本库，打破了长期仅依赖国外基因数据库分析中国人罕见病的局面。是2项专利的主要发明人。） | |
8.程雅婷（副教授、硕士、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点二遗传性代谢病的技术集成创新。是1项专利的主要发明人，是1篇代表性论文的通讯作者，是1项成果的主要完成人。） | |
9.莫桂玲（中级、硕士、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一针对目前NGS技术DNA损伤严重、靶向区域捕获效率低且不均匀、覆盖区域不完整的问题，创新NGS的反应体系；创新点三在国内首次诊断罕见异常血红蛋白突变[β43(CD2) Glu→Lys]，序列被GeneBank收录。是1项专利的发明人，是2篇论文的作者，是1项成果的主要完成人。） | |
10.赵蓓蓓（中级、硕士、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一创建液相色谱串联质谱技术的样本前处理方法，解决了免疫法反应交叉干扰严重和质谱法分离效果差、浓缩提取难的问题，提高了遗传代谢病检测精准度。是1篇代表性论文的主要作者，是1项专利的主要发明人。） | |
11.喻长顺（中级、博士、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验集团股份有限公司、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一创新了下一代基因测序的反应体系和数据分析算法；创新点四构建了基于中国人群数量大、病种全、地域广的罕见病实验诊断数据库及样本库，打破了长期仅依赖国外基因数据库分析中国人罕见病的局面。是2项专利的主要发明人，是2篇论文的主要作者。） | |
12.孙明明（中级、本科、广州金域医学检验中心有限公司、广州金域医学检验中心有限公司、主要贡献：1. 项目技术研究主要成员，主导完成了创新点一：针对NGS数据分析复杂、漏检率高、检出率低、分析模块不衔接和耗时长问题，发明基因变异评估方法并研发NGS数据生物信息分析系统；创新点四：构建了基于中国人群数量大、病种全、地域广的罕见病实验诊断数据库及样本库，打破了长期仅依赖国外基因数据库分析中国人罕见病的局面。 2.是1项专利的主要发明人。） | |
13.陈敏（副主任医师、博士、广州医科大学附属第三医院、广州医科大学附属第三医院、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点二创建罕见病多组学诊断技术路径，攻克了部分罕见病复杂性、异质性导致无法通过单一检测技术确诊的难题。是“遗传性疾病综合检测技术的集成研发和规模应用”成果的主要完成人。） | |
14.林晓莹（中级、博士、广东省第二人民医院、中山大学、主要贡献：项目技术研究主要成员，主导完成了创新点二检测血友病B的技术集成创新。是1篇论文的作者。） | |
15.李志华（副主任医师、博士、广州医科大学附属第三医院、广州医科大学附属第三医院、主要贡献项目技术研究主要成员，主导完成了创新点二：创建罕见病多组学诊断技术路径，攻克了部分罕见病复杂性、异质性导致无法通过单一检测技术确诊的难题。是“遗传性疾病综合检测技术的集成研发和规模应用”成果的主要完成人。） | |
项目简介 | 本项目属于实验诊断学领域。重点针对单一技术诊断罕见病检出率低、精准度低、漏诊误诊率高、周期长，长期仅依赖国外基因数据库分析中国人罕见病等突出问题，通过近20年罕见病筛查、诊断技术积累，创新关键检测技术，并规模化用于罕见病精准诊断。主要创新点如下： （一）创新研发了罕见病系列筛查诊断技术，大幅提升检测灵敏度和检测效率。 创新NGS的反应体系，研发新重悬缓冲液、新捕获探针等，提高灵敏度和检出率并降低成本，解决靶区域捕获效率低且不均匀、覆盖区域不完整的问题；自主研发生物信息分析系统，实现数据自动分析、变异预测，检索速度提升3-8倍，解决漏检率高、流程不衔接和耗时长问题；通过研发新算法和模块化操作流程，缩减DNA模板稀释体积，解决绒毛组织DNA不易提取、稳定性差和质控难的问题；构建染色体核型细胞培养和制片新技术，成功率提升至99.7%，解决原方法含有毒试剂和培养失败率高问题；创建液相色谱串联质谱技术样本前处理方法，单次检测节省10个步骤40分钟，解决了离子抑制和交叉干扰问题。 （二）创建罕见病多组学诊断技术路径，攻克了部分罕见病复杂性、异质性导致无法通过单一检测技术确诊的难题。自主设计并深度优化罕见病检测流程和实验诊断方案，有效集成基因及基因组、代谢组及蛋白质组、细胞及组织病理等检测技术，已规模应用；研究并建立了一套全面的血友病B基因诊断方案，可覆盖胚胎植入前诊断、产前和产后基因诊断等环节，该方案诊断的结果与妊娠结局完全一致，避免了患儿出生；联合运用质谱和基因检测技术，确诊遗传代谢性罕见病及病因，使患者贫血、发育落后等症状得到极大改善。 （三）首次发现3种罕见病基因变异类型、揭示2种临床诊断相同的罕见染色体病的不同致病机制、诊断多种罕见病，为罕见病实验诊断提供科学依据。国内首次诊断罕见异常血红蛋白突变和染色体缺失/重复等3种未被Genebank和国际权威遗传病数据库收录的罕见病；在国际上新发现RBFOX1基因内缺失、15q15.3q21.2原位重复、2q22.3拷贝数增加等3种罕见病基因变异类型并评估其临床诊断意义；在国际首次阐明了21三体和罗氏易位临床诊断相同而产生机制不同的染色体病，对产前筛查、优生优育和公共卫生等具有重要意义。 （四）构建了基于中国人群数量大、病种全、地域广的罕见病实验诊断数据库及样本库，打破了长期仅依赖国外基因数据库分析中国人罕见病的局面。已被广泛应用的收录4万余例罕见病阳性病例及其实验诊断数据库，解决了依赖国外基因数据库分析中国人罕见病不精准的问题，为提升中国人罕见病致病性分析精准性和开展中国人群罕见病诊疗研究提供了宝贵的病例和数据资源。 本项目共授权发明专利20件、计算机软件著作权77件、发表论文36篇。成果已为全国22000多家医院应用，覆盖全国90%人口地区，2014-2016年实现收入3.27亿元，带动金域医学实现收入74.49亿元，显著提高了罕见病诊断的时效性、灵敏度和特异性，提升了我国罕见病的精准诊疗能力，有效解决医疗资源分布不均衡的问题，助力“健康中国2030”战略实施。 |
代表性论文 专著目录 | 论文1：<Intragenic deletion of RBFOX1 associated with neurodevelopmental/neuropsychiatric disorders and possibly other clinical presentations> |
论文2：<染色体微阵列技术在2000例儿科患者中的应用> | |
论文3：<Robertsonian Translocations: An Overview of 872 Robertsonian Translocations Identified in a Diagnostic Laboratory in China> | |
论文4：<Postnatal Identification of Trisomy 21: An Overview of 7, 133 Postnatal Trisomy 21 Cases Identified in a Diagnostic Reference Laboratory in China> | |
论文5：<A de novo triplication on 2q22.3 including the entire ZEB2 gene associated with global developmental delay, multiple congenital anomalies and behavioral abnormalities> | |
论文6：<A rare de novo interstitial duplication of 15q15.3q21.2 in a boy with severe short stature, hypogonadism, global developmental delay and intellectual disability> | |
论文7：<Establishing a comprehensive genetic diagnosis strategy for hemophilia B and its application in Chinese population> | |
论文8：<联合应用MLPA技术和基因测序技术检测DMD基因单个外显子缺失突变> | |
论文9：<我国罕见异常血红蛋白突变型[β43(CD2) Glu→Lys ]分析> | |
论文10：<甲基丙二酸血症合并同型半胱氨酸血症1例病例报道> | |
知识产权名称 | 专利1：<一种检测IDH1和IDH2基因突变的引物与方法>（ZL201510568734.4） |
专利2：<一种检测JAK2基因突变的引物与方法>（ZL201510568654.9） | |
专利3：<一种基因变异评估方法及系统>（ZL201710378155.2） | |
专利4：<一种缺失型a地中海贫血-2基因及其检测试剂盒和PCR测序方法>（ZL201110320542.3） | |
专利5：<一种人尿氢化可的松的检测方法>（ZL201310242425.9） | |
专利6：<一种高通量测序数据前期处理方法>（ZL201510830815.7） | |
专利7：<一种检测少儿耳聋遗传风险的引物、试剂盒、检测方法>（ZL201610651209.3） | |
软件著作权1：<基于BLAST结果的Evalue统计工具软件>（2019SR0084884） | |
软件著作权2：<NGS数据覆盖度统计工具软件>（2018SR756039） | |
软件著作权3：<无创胎儿微缺失微重复分析软件 V1.0>（2017SR209785） | |
推广应用情况 | 本项目技术创新成果成功应用于1332家三级医院，与北京协和医院联合开展“罕见病临床队列研究”，与中国罕见病联盟（经国家卫健委批准）成员单位四川大学华西医院、上海儿童医学中心、哈尔滨医科大学附属第一医院、新疆维吾尔自治区人民医院、广东省人民医院和广州呼吸疾病研究所等大型三甲医院，开展罕见病精准诊断科研合作与临床诊疗协作，充分发挥第三方医学检验机构技术和汇集多方罕见病病例资源优势，面向医院提供规模化应用罕见病临床检测技术项目和最优化分析诊断方案。 |
